بدأ آل مكتوم مسيرته المهنية في مجال الطيران عام 1985 حين عُيّن رئيسًا لدائرة الطيران المدني بدبي. كما تولى في العام نفسه رئاسة مجلس إدارة طيران الإمارات التي تأسست حديثًا آنذاك، حيث أطلقت الشركة عملياتها بطائرتين مستأجرتين، ورحلات تسير إلى وجهتين من دبي. أما اليوم فتسافر إلى أكثر من 150 وجهة عبر 6 قارات، وأسطول يزيد عن 263 طائرة حتى نهاية نوفمبر/ تشرين الثاني 2022. وتملك طيران الإمارات أكبر أسطول في العالم من طائرات بوينغ 777 وإيرباص A380. وقد ارتفعت إيرادات المجموعة 128% في النصف الأول من العام المالي 2022/23، لتصل إلى 15.3 مليار دولار. يشغل آل مكتوم أيضًا منصب النائب الثاني لرئيس المجلس التنفيذي لإمارة دبي، ورئيس اللجنة العليا للسياسة المالية في إمارة دبي.