تسهم شركة الاتحاد للقطارات في تحقيق هدف الإمارات للوصول إلى صافي انبعاثات صفرية بحلول عام 2050. وستقلل شبكة السكك الحديدية الوطنية انبعاثات الكربون في قطاع النقل البري بنسبة 21% بحلول عام 2050، حيث تحل كل رحلة قطار محل نحو 300 شاحنة على الطريق. وتراقب الشركة انبعاثات العوادم بناء على المعايير التي وضعتها وكالة حماية البيئة الأميركية. بالإضافة إلى ذلك، عقدت الاتحاد للقطارات شراكة مع جمعية الإمارات للطبيعة، وبلدية الفجيرة، وهيئة الفجيرة للبيئة، ومركز الفجيرة للمغامرات، لإطلاق برنامج لحماية البيئة واستعادة الموائل الطبيعية في منطقة البثنة بالفجيرة.