تولى آل مكتوم منصب رئيس مجلس إدارة طيران الإمارات، ورئيس دائرة الطيران المدني في دبي عام 1985. ودشنت طيران الإمارات عملياتها في العام نفسه بطائرتين، وتوسعت اليوم لتصبح مجموعة الإمارات التي تضم أيضًا شركة دناتا، وتملك أكبر أسطول في العالم من طائرات بوينغ 777 وإيرباص (A380). مع نهاية ديسمبر/ كانون الأول 2023، ضم أسطولها 260 طائرة في الخدمة، وسيرت رحلات إلى 143 وجهة. فيما تعد دناتا من شركات الخدمات الجوية التي تعمل في أكثر من 30 دولة. وقد قفزت إيرادات مجموعة الإمارات بنسبة 81% في العام المالي 2022/ 2023، لتصل إلى 32.6 مليار دولار، منها 29.3 مليار دولار إيرادات طيران الإمارات التي نقلت 43.6 مليون راكب. يشغل آل مكتوم أيضًا منصب الرئيس في مطارات دبي وسلطة دبي للمناطق الاقتصادية المتكاملة، ويتولى العديد من المناصب القيادية الأخرى في حكومة دبي.